En politirapport nyhetsbyrået AP har fått tilgang til, beskriver den 39 år gamle polakken som en journalist som hadde vært i kontakt med separatister i Papua.
Ifølge en rapport fra militæret ble han pågrepet mandag, i kjølvannet av at fem personer fra Papua-regionen ble pågrepet for besittelse av store mengder ammunisjon.
Indonesia nekter utenlandske journalister adgang til landets to østligste provinser, Papua og Vest-Papua, der et uavhengighetsopprør har ulmet i flere tiår.
Den polske ambassaden sier de er klar over pågripelsen, men henviser til det polske utenriksdepartementet for spørsmål.
Amnesty International sier Indonesias politi og militære er ansvarlige for minst 95 utenomrettslige henrettelser i Papua siden 2010.
(©NTB)